دراين بیانیه ضمن اشاره به ضرورت اصلاح رویکرد ملی نسبت به علوم انسانی آمده است: با توجه به اهمیت الگوی پیشرفت اسلامی-ایرانی و نقش مهم و مؤثر علوم انسانی در پایه ریزی و طراحی آن، تبیین این الگو باید براساس دانش اجتماعی بومی و ترسیم مسیر آن با ملاحظه ساخت و شرایط سیاسی و اجتماعی ایران، نوع دین و کیفیت ظهور و حاکمیت آن، سابقه فکری و تاریخی ایران، تأثیرات "مدرنیته" بر اندیشه و عمل نخبگان ایرانی و مسلمان و خصوصیات انسان ایرانی و فرهنگ شیعی صورت پذیرد.
در بیانیه دومین کنگره ملی علوم انسانی، استواری غالب نظریه‌های حوزه علوم انسانی و به ویژه دانش اجتماعی بر تجربه تاریخی خاص آن در غرب و تعمیم و تسری آن به جوامع دیگر ، نبودِ سازمان و سامانه‌ای ملی جهت نظام دادن به اولویت‌های پژوهشی، احاطه نگاه و روش کمیتگرا بر تحقیقات علوم انسانی، فراموش شدن نسبت آموزش در علوم انسانی با زندگی روزمره و عملی، فقدان یک چشم انداز روشن از علوم انسانی بومی، روش سنتی حافظه پروری و فقدان روحیه پرسشگری و پژوهش در دانشجویان و غفلت از فرهنگ ایثار و شهادت در محتوای دروس دانشگاهی علوم انسانی به عنوان یک سرمایه اسلامی و ملی از آسیب‌های امروز علوم انسانی یاد شده است.
شرکت کنندگان در این کنگره، تبیین الگوی پیشرفت جامعه براساس دانش اجتماعی بومی و ترسیم مسیر آن با ملاحظه ساخت و شرایط اجتماعی ایران، افزایش کمی محققان تمام وقت با تاکید بر بهبود کیفیت و توسعه منابع انسانی پژوهشی. رفع موانع حوزه نظریه پردازی در علوم انسانی و استفاده از دستاوردهای علوم انسانی در جوامع دیگر با عطف توجه به لزوم خارج کردن علوم انسانی از حالت نقلی صرف (ترجمه) و ضرورت کاربردی کردن آن (آموزش و پژوهش) و لزوم حاکمیت ارزش‌های قرآنی، دانش مداری و معنویت را ازجمله راهکارهای حل مشکلات علوم انسانی ذکر کرده‌اند.(فارس)
بیانیه پایانی دومین کنگره ملی علوم انسانی با توصیف جایگاه علوم انسانی و شرایط امروز آن، چالش و موانع علوم انسانی و ارائه راهکار های تقویت علوم انسانی صادر شد.